麸质过敏这个词，越来越多地出现在我们身边的人身上；其它各种奇怪的身体不良反应，都被冠以“食物过敏”，因此不能吃小麦制品、鸡蛋制品、牛奶制品等等。
有个说法是以前的食品品种和品质没有转基因、没有杂交，所以必现在的更好更安全，但西方人体科学与营养学的研究资料显示，过敏、便秘、哮喘、肥胖、儿童糖尿病、胃食管反流病、湿疹、乳糜泻、自闭症等现代高发的疾病都与微生物有关，微生物就是我们常说的细菌；有些研究报告说，人体肠道中的细菌的种类和数量决定了身体的健康程度。当然，中医养生的观点不会这样，那么我们就从西方生物学的角度来探索一下对细菌对人健康的观点。
受法国细菌学先贤巴斯夫的影响，有个普遍的观点是：“细菌感染会致命，至少产褥热是这样，一旦隔绝了细菌感染，就不会生病致命”，进而延伸的是：“太多的细菌会导致我们生病或者过敏”；经过多年的临床积累和统计，情况正好相反，人体身上细菌的种类和数量，是真正影响我们身体健康的决定性因素，平衡被打破，身体就会出状况。
事实上。我们根本无法清出所有的微生物；
一般来说，人的身体由 30 万亿个细胞组成，但是它却容纳了超过 100 万亿个细菌与真菌细胞，这些微生物朋友们与我们协同进化。在世界上已知的 50 个门的细菌之中， 人体中已经发现了 8–12 个。这些细菌加在一起大约有7～8千克重，比人的大脑还重；人类体内的细菌数量和细胞总量不相上下。每一个人类基因都可能携带上百个微生 物基因。此时此刻，大约有 10000 种不同种类的微生物（包括细菌、病毒和真菌）正在你的体内生存。
每个人都被自己特有的微生物群所伴随，其中包括细菌、酵母和细胞。它们漂浮在你身体周围的空气中，有个特别的名字——“微生物云”。微生物从皮肤上脱落，伴随着你的每次呼吸和移动发散到空气中。当你靠近别人的时候，你和他就在交换彼此身上的微生物。每个人的微生物云都独一无二，甚至可以用来确定你的身份。
居住在人体肠道中的微生物组成了微生物群，又叫肠道菌群。它大约包含数十万亿个 微生物，其中有至少 1000 种不同的已知细菌。一个人微生物群的三分之二由生活环境和摄入的食物决定；有研究显示，你想吃什么食物，首先是细菌想要吃，然后细菌给大脑传递信息，从而大脑决定选择你要吃什么食物；当然，这个还需要更多的证据来支持。
生活中，即便我们在打扫的很干净的屋子里，我们仍然跟数量庞大、肉眼看不见的微生物生活在一起。约 有63000 种不同的真菌和 116000 种不同的细菌，将我们的屋子当成它们自己的家。有个不大愉快的事实是：生活在马桶垫上的细菌和生活在枕头上的数量差不多。今晚当你入睡时，大约有 100 万个真菌孢子在你身边游荡；每时每刻都有细菌和螨虫在你的脸上爬来爬去。
非常肯定地说，人和微生物是一个生态系统，是一种共生状态。
目前，越来越多的研究结果都指向了一个方向：人体内消失的微生物菌群的多样性，正在给我们带来难以预测的健康后果。
人体微生物菌群的获得是从母亲分娩的那一刻获得的，孩子通过母亲的阴道来到人间的过程就从母体获得了大量微生物，婴儿的皮肤就像海绵，吸收了它周围的乳酸杆菌，婴儿吸入的第一口汁液包含了母亲阴道里的微生物，也不排除有肠道微生物，一旦出生，婴儿本能的寻找母亲的乳头开始吮吸，于是，婴儿嘴上的大量乳酸杆菌就混着第一口母乳进入了体内。
到三岁左右，这些菌群基本稳定下来， 但是剖宫产的孩子却因为失去了这个过程中很重要的一部分，从而更多可能地产生不同程度地过敏现象；事实上与人类共生的微生物在几百万年的进化过程中一直与人类本身同步进化，丰富的微生物多样性也伴随着人类的繁衍代代相传。
但是近 100 年来， 抗生素的出现打破了这种相关性，抗生素好不留情地灭掉了细菌，不管是不是人体需要的或者是对身体有益的。随着抗生素使用越来越普遍和频繁，我们已经在逐渐丢失了伴随了人类几百万年的微生物多样性。与此同时，糖尿病、肥胖、各种食物过敏等疾病却急剧增加。而且这种趋势在发达国家和发展中国家是几乎无差别的。这提示我们必须重视抗生素滥用的严重后果，人体微生物多样性平衡的重建，势必成为当下人体健康的重要基础。
曾获得 2005 年诺贝尔医学奖的巴里马歇尔和罗宾沃伦通过临床试验表明， 用抗生素清除幽门螺杆菌可以治愈胃溃疡，但是与此同时，也有证据表明，幽门螺杆菌是人体内正常肠道菌群的一员，对维护我们健康发挥了重要的作用，幽门螺杆菌可能对某些成年人有害，但它们对孩子却是有益的，然而，幽门螺杆菌的完全消失又和胃食管反流共生共存。
幽门螺杆菌的演化历史极为悠久，遗传学研究显示，人类携带幽门螺杆菌已经有十多万年了，这个时间跨度已经是目前的检测手段所能达到的极限了。一般来说，医生接受到的教育是胃炎是一种病理炎症反应，但是，现在看来，我们有充分的理由质疑它到底是一种病理反应， 还是胃对于共生细菌的正常反应。
很多实验室通过大量研究表明：幽门螺杆菌可以通过引起炎症反应影响胃部的荷尔蒙，调节胃酸的分泌。随着现代越来越洁净的生活、抗生素的使用，幽门螺杆菌在人体内存在的比例在逐渐减少，随着人的衰老，它会增加患胃溃疡与胃癌的概率，但与此同时，也保护了食管，降低患胃食管反流疾病或者其他一系列癌症的概率。
人的身体是一个如热带雨林一般的生态系统，是一个由相互关联的生命形式 组成的复杂组织，如同所有的生态系统一样，多样性至关重要，微生物种类高度的多样性为系统内所有的物种提供了保护，因为它们之间的相互关联创造了一个稳定的网络， 保证了资源的获取与流动，多样性的丧失会危害生态系统的健康，而关键种的丧失则会导致生态系统崩溃。
滥用抗生素对我们身体的危害众多。
1943 年，人们从土壤中的细菌里发现了第一种有效治疗结核分枝杆菌的药物——链霉素。然后是更多的抗生素：四环素、红霉素、氯霉素等，将我们带入了抗生素的时代，与此同时，科学家通过对天然产物的化学修饰制造出了新形式的半合成药物，以及完全人工合成的或者非天然的化合物。目前，为了方便称呼， 人们将这类药物称为抗生素。
滥用抗生素引发了诸多问题，比如人体携带的细菌变得能耐受抗生素了。阿莫西林属于光谱抗生素，能杀灭许多种细菌，也就意味着在消灭病原体的同时也消灭掉了身体内的那些易感群体。就像是地毯式轰炸。近几十年里，青霉素、大环内酯类药物、四环素类药物、氟喹诺酮类药物以及硝基咪唑类药物的耐受性菌株都在增加。如果让小鼠口服摄入一次链霉素，隔几天再喂以沙门菌，这次仅仅需要 3 个细菌就足以感染它们。
更为惊人的是，我们制造的大多数抗生素其实并没有用到人体上，而是用到工业化养殖场了， 因为养殖场密度过大，生活环境差，动物极易生病，所以需要给动物喂饲抗生素， 但其实，人们使用的抗生素剂量并不足以治疗感染，低剂量的抗生素也可以帮助动物增肥；糟糕是导致了动物体内耐药细菌的积累以及抗生素在食物与水体中的残留。养殖户只要花很小的代价，就可以使得动物在正常体重基础上增重 5--‐10%，乃至 15%， 这也就意味着更高的效率，更好的利润。
医药公司发现这里有巨大的利润，卖给医生的抗生素以毫克计，而卖给工业化养殖场的却以吨计。今天，70--‐80%的抗 生素都用于增肥动物，2011 年动物养殖业共购买了接近 1260 万千克重的抗生素。
瑞典在 1986 年就禁止了在动物身上使用抗生素来促进生长的做法，欧盟从1999 年也禁止了这种做法。中国政府将在 2020 年禁止在动物养殖饲料里添加抗生素。同样的微生物与同样的耐抗生素模式已经出现在了病人与抗生素饲养过的动物身上。但为时已晚，我们已经有太多被抗生素影响的不可逆转的事实了。
在儿童和成人身上持续的抗生素的滥用、剖宫产以及对畜牧动物使用大量药物，所有这些都不可避免的影响了我们身上所有的细菌，无论他们是敌是友，可以做出的初步假说是：许多现代疾病：肥胖、青少年糖尿病、哮喘等，正是由于失去了这些世代传承、功能保守的微生物居民而导致的。
到目前为止，人们还是谈细菌色变，医生对于抗生素的使用仍然是主流，而且担心如果不开这些处方会被告上法庭，医药公司只要做出很小投入不必投资生产新药，就有足够丰富的回报。
粪菌移植疗法是一种创新的治疗手段，通俗讲就是将某人粪便中的细菌移植到另一个人体内，2013 年来自荷兰的科学家进行了 一项关键研究，研究人员对反复艰难梭状芽胞杆菌感染的患者进行了随机临床测试——受试者有机会选择接受传统抗生素治疗或者是粪菌移植。结果，接受了抗生素的治愈率是 31%，而接受了粪菌移植的治愈率是 94%。
阿克斯博士是美国知名的自然医学医生，他认为，过敏、肥胖、抑郁等疾病都源于我们的肠道，源于“肠漏症”。其中，现代生活中的环境毒素是一个原因，蔬果中的农残、肉类中的抗生素残留、塑料制品中的有害物质、现代的加工类食品，都可能导致肠道屏蔽损伤，造成肠漏。除了抗生素的滥用破坏肠道健康外，还有现代饮食、过度清洁、便利生活、压力等都会导致肠道不健康。
2000 年前，古希腊名医希波克拉底就发现，有些女性在怀孕的时候会爱上吃土。在中国古代，游子远走他乡时，常常带上一包故乡土泡水喝，用于治疗水土不服。在非洲，那些原始部落的居民每天会吃上 30g 的深层土用于健康保健。
我们的消化系统运作是从我们吃第一口食物开始的，甚至只是闻到或者看到食物，口腔就开始迅速分泌唾液，唾液中含有食物遇到的第一种酶，这种酶可以在咀嚼的过程中分解碳水化合物，咀嚼还会向胃发出信号通知胃准备好胃酸，命令胰腺向小肠分泌其它消化酶。咀嚼能保证食物被咬碎，使得消化酶充分处理小块食物，如果咀嚼不充分， 不被消化就进入结肠，导致消化不良和胀气。接下来食物进入食道落到胃中，胃壁会将食物分解成半流体状的食糜，胃酸可以杀死有害细菌，帮助胃消化酶分解蛋白质。
如果胃未产生足够的胃酸，就可能导致胃酸反流，小肠细菌过度繁殖的风险就会提高，而这正是肠漏症的主要起因之一。食糜离开胃部进入小肠（6 米长），胰腺、肝脏和胆囊都会分泌消化液，帮助小肠将食物分解成维生素、矿物质、蛋白质、碳水化合物和脂肪等人体需要的营养物质，食物离开小肠进入大肠时，约90%的营养物质就已经被吸收了，食物残渣（纤维素）会在结肠中停留更长时间， 为寄居在结肠中的大量微生物提供营养，微生物数量也从几百个到上千个、数千、数百万乃至数十亿个，最终在结肠中会达到数万亿（双歧杆菌、乳酸菌）。
那我们现在可以做什么改变呢？
首先，尽一切可能避免抗生素的使用和间接摄入，自然分娩、母乳喂养、吃有机食物、保持健康生活方式预防疾病；
其次，多接地气；一个偶然的研究发现，接触地面的负电荷与电塔上的接地线类似。皮肤与地面的接触能够通过调节身体功能来稳定内在生物电环境。赤脚在地面上走动会是一个很好的方法。这种电荷交换能够设置生物钟、调节昼夜节律和平衡皮质醇水平。在中国农村，小孩子基本上都要赤脚在土地上玩耍的经历，这样对身体的生长有着积极的作用，中医的角度认为是养脾胃的一种重要方法。
