赵园自从事学术研究以来，即致力于经由文学探究中国现代史上知识分子的处境与命运，《艰难的选择》（上海文艺出版社，1986）是这一方向上的最初的成果。由该书的结构及问题意识，可辨1980年代学术的鲜明印记。《地之子》（北京十月文艺出版社，1993）是一部经由文学研究中国知识分子与乡村、与农民文化的关系的专著。该书以“文学─ 知识分子”为基本线索，分析了二十年代以来作品中“大地”、“乡土”、“荒原”等意象中的知识者意识，论述了有关作品中的“农民”形象的文化意蕴、作者作为知识者对农民文化的重要方面（如土地意识、性文化等）的概括与诠释；本书还将“知青作者与知青文学”作专章论述。《论小说十家》（浙江文艺出版社。1987）是作家论的结集，收有关于鲁迅、老舍、沈从文、萧红、张爱玲、路翎等作家的专论。《北京：城与人》（上海人民出版社，1991）以老舍与当代京味小说为基本材料，阐述关于北京历史文化的理解，是赵园的学术著作中引起较大关注的一部。《北京：城与人》、《地之子》均获社科院文学所优秀科研成果奖。

《明清之际士大夫研究》（北京大学出版社，1999）是一部以明清之际的思想及文化现象为研究对象的学术著作。全书分上下两编，上编为明清之际士人话题研究，下编为明遗民研究。著者依据明清之际思想、言论活跃这一事实，在本书上编对其时士人的若干话题进行了分析，所分析的话题包括了士人对于与“易代”有关的某些重要经验的反省，关于某些文化现象的论说，以及有明国初的重大事件“建文逊国”作为话题在明末清初语境中的展开；部分地作为对上述言论现象的解释，还梳理并分析了其时与“言论”（如“言路”、“清议”等）有关的言论。下编作为有关明遗民的专题研究，由如下方面展开：出诸明遗民的有关“遗民”、“遗民史”的论说；以遗民的自我述说及遗民传状为材料的遗民生存方式分析；关于“遗民”作为时间现象；与“遗民学术”（包括经学、史学、文论等）。本书所研究的课题有思想史的意义；研究者的专业背景，又使其著作包含了较为丰富的心态史的内容。其中对于明清之际重要的思想史、学术史人物如王夫之、顾炎武、黄宗羲等由本书所设角度的论述，无疑有一定的启发性。该书出版后，引起了较大反响，《中国图书商报·书评周刊》、《中华读书报·书评广场》、《读书》杂志、香港《二十一世纪》先后发表了书评，并获首届“长江读书奖”专家著作奖。